水貂酪氨酸酶(TYR)基因克隆、SNPs筛查及其皮肤组织mRNA差异表达分析

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作   者：

宋兴超;  刘琳玲;  潘虹军;  赵家平;  贾赟;  杨福合;  徐超; 

作者机构：

中国农业科学院特产研究所;  大连海关技术中心;  铜仁学院; 

关键词：

差异表达;  水貂;  单核苷酸多态性;  皮肤;  毛色性状;  酪氨酸酶基因; 

期刊名称：

畜牧兽医学报

基金项目：

习近平军民融合发展战略思想体系研究

i s s n：

年卷期：

2021 年 001 期

页   码：

66-76

摘   要：

旨在克隆和分析水貂酪氨酸酶（tyrosinase,TYR）基因编码区,揭示该基因编码区SNPs及其皮肤组织mRNA差异表达规律与水貂毛色表型的关系。本研究采集7月龄雄性金州黑水貂、名威银蓝水貂和红眼白水貂共计301个样本的血液,利用聚合酶链式反应（PCR）方法对水貂TYR基因5个外显子进行分段克隆,并拼接获得其完整编码区序列（coding sequence,CDS）;采用PCR产物直接测序技术筛查3种毛色水貂外显子1、4和5中的SNPs;采集9只7月龄雄性水貂（黑、灰与白色被毛各3只）背中部皮肤组织,通过实时荧光定量PCR（quantitative real-time PCR,qRT-PCR）技术检测TYR基因mRNA在3种毛色水貂皮肤组织中的表达水平。结果表明,克隆的水貂TYR基因序列长2 391 bp,由5个外显子组成,编码区长1 596 bp,编码的531个氨基酸中包括信号肽（18个氨基酸）和成熟肽（513个氨基酸）,该序列已上传GenBank（KJ716783）。SNPs筛查发现,3种毛色水貂TYR基因外显子4和5不存在突变位点,外显子1发现2处变异:c.441G>A和c.138T>A,c.441G>A为同义突变且仅存在于金州黑水貂群体。qRT-PCR分析显示,TYR基因mRNA在3种毛色水貂皮肤组织中均表达,且在金州黑水貂中的表达极显著高于银蓝水貂和红眼白水貂（P<0.01）,在银蓝水貂中的表达显著高于红眼白水貂（P<0.05）。研究结果提示,TYR基因c.138T>A位点及其皮肤组织mRNA差异表达水平与水貂毛色显著关联。