CD44差异表达在胶质母细胞瘤中的生物信息学分析及细胞实验验证

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作   者：

孙旭;  李顺顺;  王殿恒;  王珍凤; 

作者机构：

中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院免疫学系重大疾病共性机制研究全国重点实验室; 

关键词：

生物信息学;  细胞功能;  胶质母细胞瘤;  泛癌;  CD44; 

期刊名称：

基础医学与临床

i s s n：

1001-6325

年卷期：

2024 年 006 期

页   码：

800-808

摘   要：

目的 探究CD44差异表达在胶质母细胞瘤（GBM）中的临床意义以及相关通路的富集并以胶质母细胞瘤细胞系U87进行实验验证。方法 通过差异表达和Cox分析确定泛癌转录组中肿瘤患者与健康人的CD44表达是否具有差异以及风险比（HR）;比较GBM患者CD44高、低表达组的免疫浸润及干细胞相关评分，并进一步分析各免疫细胞亚群是否具有差异及其与CD44的相关性；对GBM患者CD44高、低表达组差异表达的基因进行通路富集；通过构建、包装慢病毒和运用电转核糖核蛋白复合体的方法在U87细胞中过表达（OE）、敲低（KD）以及敲除（KO）CD44;对U87和U87 CD44 OE细胞进行CD44的免疫荧光染色；敲低CD44对U87细胞的活力与凋亡进行检测，敲除CD44对U87细胞的迁移与侵袭能力进行检测。结果 CD44在GBM中表达较高与健康人差异明显（P＜0.05）,且HR＞1。高表达CD44的GBM患者具有较高的基质细胞与免疫浸润评分以及较低的细胞干性，CD44高、低表达的GBM患者的树突状细胞、CD4+记忆T细胞和调节性T细胞具有明显差异，且与CD44表达呈正相关（P＜0.05）。CD44高、低表达的GBM患者的差异基因富集在与细胞迁移与凋亡的相关通路（P＜0.05）。U87细胞实验表明，CD44正常情况定位在细胞膜，但CD44 OE后会在细胞质中发生蓄积。CD44 KD会导致细胞活力下降，细胞发生凋亡，CD44KO的细胞迁移与侵袭能力也会下降（P＜0.05）。结论 CD44表达降低可以促进U87细胞活力降低、凋亡比例升高，侵袭与迁移能力下降，可能是影响GBM患者预后的相关因素。