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红花CDPK基因家族的鉴定及表达分析
- 作 者:
-
胡祥祥;
许姣;
宋梦瑶;
朱畇昊;
- 作者机构:
-
河南中医药大学药学院;
- 关键词:
-
红花;
CDPK基因家族;
染色体定位;
表达分析;
生物信息学分析;
- 期刊名称:
- 江苏农业科学
- i s s n:
- 1002-1302
- 年卷期:
-
2023 年
004 期
- 页 码:
- 39-46
- 摘 要:
-
钙依赖性蛋白激酶(CDPK)是植物细胞内Ca2+信号识别及转导的重要媒介,在植物的生长发育以及逆境响应过程中起着重要的作用。本研究通过多种生物信息学的方法和手段,对鉴定出来的30个CDPK基因进行分析鉴定,结果显示30个CtCDPK基因所编码的氨基酸分子量为47 781.96~93 251.66 ku,等电点为5.09~9.27;基因结构预测结果表明,所有CtCDPK基因均含有6~13个外显子;染色体定位结果表明,30个CtCDPK基因分别定位在10条染色体上,其中8号染色体上最多,有5个,2号、4号染色体上没有;系统发育树分析结果显示将其分为6个亚家族;表达分析结果表明CtCDPK基因在不同组织、不同发育阶段中表达模式有所差异。
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