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卵巢癌乳酸化修饰亚型的鉴定及预后评分模型构建与免疫疗效预测

作   者:
林子丹周琛斐黄舒婷巢锦瑜何善阳
作者机构:
广东省心血管病研究所广东省人民医院妇科南方医科大学第五附属医院妇科
关键词:
乳酸化修饰预后评分模型免疫治疗卵巢癌
期刊名称:
新医学
i s s n:
0253-9802
年卷期:
2025 年 56 卷 001 期
页   码:
3-19
摘   要:
目的 在卵巢癌中鉴定与乳酸化修饰相关的分子分型,构建预后评分模型,并预测免疫治疗效果。方法基于癌症基因组图谱-卵巢癌(TCGA-OV)数据集及基因表达综合数据库(GEO)的GSE63885、GSE26193数据集,对乳酸化修饰相关基因进行预后和生存分析。采用无监督聚类方法将卵巢癌患者分为4种乳酸化修饰分型(LRGCluster),并对其差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过单因素Cox回归分析(P <0.000 1),筛选出预后相关基因(PRGs),并通过实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)验证其在正常卵巢组织、早期及晚期卵巢癌组织中的表达情况。基于这些基因,进一步通过二次无监督聚类将患者分为2种基因分型(geneCluster),并构建预后评分系统LactyScore。同时,依据LactyScore分层,对样本进行免疫细胞浸润分析、免疫治疗预测及药物敏感性分析。结果 鉴定出4种LRGCluster和2种geneCluster,并筛选出5个与卵巢癌预后密切相关的差异表达基因:胶原蛋白ⅩⅥ型α1链(COL16A1)、家族转录抑制因子SPEN、含AT钩DNA结合基序1(AHDC1)、亮氨酸拉链蛋白1(LUZP1)和基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)。RT-qPCR结果显示,SPEN、COL16A1、AHDC1、LUZP1可能为预后的危险因素,而SDF2L1可能为预后的保护因素。基于这5个基因构建的LactyScore预后评分系统显示,高LactyScore组患者的生存率高于低LactyScore组。高LactyScore组患者具有较高的免疫逃逸潜力和较低的免疫治疗应答率。结论 COL16A1、SPEN、AHDC1、LUZP1和SDF2L1为与卵巢癌预后密切相关的乳酸化修饰基因亚型,这些基因具有作为卵巢癌生物标志物的潜力。基于这5个基因构建的LactyScore预后评分系统可有效预测卵巢癌患者的预后,并为不同患者分层提供免疫治疗效果预测依据。
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