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卵巢癌乳酸化修饰亚型的鉴定及预后评分模型构建与免疫疗效预测
- 作 者:
-
林子丹;
周琛斐;
黄舒婷;
巢锦瑜;
何善阳;
- 作者机构:
-
广东省心血管病研究所;
广东省人民医院妇科;
南方医科大学第五附属医院妇科;
- 关键词:
-
乳酸化修饰;
预后评分模型;
免疫治疗;
卵巢癌;
- 期刊名称:
- 新医学
- i s s n:
- 0253-9802
- 年卷期:
-
2025 年
56 卷
001 期
- 页 码:
- 3-19
- 摘 要:
-
目的 在卵巢癌中鉴定与乳酸化修饰相关的分子分型,构建预后评分模型,并预测免疫治疗效果。方法基于癌症基因组图谱-卵巢癌(TCGA-OV)数据集及基因表达综合数据库(GEO)的GSE63885、GSE26193数据集,对乳酸化修饰相关基因进行预后和生存分析。采用无监督聚类方法将卵巢癌患者分为4种乳酸化修饰分型(LRGCluster),并对其差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。通过单因素Cox回归分析(P <0.000 1),筛选出预后相关基因(PRGs),并通过实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)验证其在正常卵巢组织、早期及晚期卵巢癌组织中的表达情况。基于这些基因,进一步通过二次无监督聚类将患者分为2种基因分型(geneCluster),并构建预后评分系统LactyScore。同时,依据LactyScore分层,对样本进行免疫细胞浸润分析、免疫治疗预测及药物敏感性分析。结果 鉴定出4种LRGCluster和2种geneCluster,并筛选出5个与卵巢癌预后密切相关的差异表达基因:胶原蛋白ⅩⅥ型α1链(COL16A1)、家族转录抑制因子SPEN、含AT钩DNA结合基序1(AHDC1)、亮氨酸拉链蛋白1(LUZP1)和基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)。RT-qPCR结果显示,SPEN、COL16A1、AHDC1、LUZP1可能为预后的危险因素,而SDF2L1可能为预后的保护因素。基于这5个基因构建的LactyScore预后评分系统显示,高LactyScore组患者的生存率高于低LactyScore组。高LactyScore组患者具有较高的免疫逃逸潜力和较低的免疫治疗应答率。结论 COL16A1、SPEN、AHDC1、LUZP1和SDF2L1为与卵巢癌预后密切相关的乳酸化修饰基因亚型,这些基因具有作为卵巢癌生物标志物的潜力。基于这5个基因构建的LactyScore预后评分系统可有效预测卵巢癌患者的预后,并为不同患者分层提供免疫治疗效果预测依据。
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