基于cELISA检测的绵羊抗布鲁氏菌病性状全基因组关联分析

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作   者：

武上杰;  李佳佳;  蒋琳;  马月辉;  丁家波;  何晓红; 

作者机构：

中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 

关键词：

全基因组关联分析(GWAS);  绵羊;  竞争酶联免疫吸附试验(cELISA);  布鲁氏菌病; 

期刊名称：

中国畜牧兽医

i s s n：

1671-7236

年卷期：

2024 年 51 卷 010 期

页   码：

4191-4199

摘   要：

[目的]挖掘与绵羊布鲁氏菌病抗性或易感性相关的基因,以期为绵羊布鲁氏菌病抗病育种提供分子标记.[方法]以自然感染布鲁氏菌病并且未注射疫苗的绵羊为研究对象,采集50只绵羊的血液样本进行竞争酶联免疫吸附试验(competitive enzyme-linked immunosorbent assay,cELISA).对绵羊血液DNA进行全基因组重测序,以cELISA结果为数量性状表型,利用GEMMA软件进行全基因组关联分析.使用clusterProfiler软件包对显著基因进行功能富集分析.[结果]全基因组关联分析筛选到Top 1 000的位点共注释到56个基因,GO功能富集结果显示,注释基因主要富集在β选择和αβT细胞增殖和分化等条目;KEGG通路富集分析结果显示,注释基因主要富集在Th1/Th2/Th17细胞分化和自然杀伤细胞介导的细胞毒性等通路,主要涉及γ-干扰素受体1(interferon gamma receptor 1,IFNGR1)、活化 T 细胞核因子 2(nuclear factor of activated T cells 2,NFATC2)、NF-κB 抑制因子 β(NF-κB inhibitor beta,NFKBIB)、脾酪氨酸激酶(spleen associated tyrosine kinase,SYK)、转化生长因子β受体2(transforming growth factor beta receptor 2,TGFBR2)和 T 细胞受体相关蛋白激酶 70 的 Zeta 链(Zeta chain of T cell receptor associated protein kinase 70,ZAP70)共6个基因,筛选到的条目、通路和基因与布鲁氏菌的感染或宿主的抗感染密切相关.[结论]本研究筛选到6个与绵羊布鲁氏菌病相关的基因,为进一步细胞或个体水平的功能验证奠定了基础,为绵羊布鲁氏菌病抗病育种分子标记提供了参考.