The present invention provides a measure that makes it possible to predict the effect of a pharmacotherapy on cancer including HER2-positive cancer. More specifically, the present invention provides a method for predicting the effect of a pharmacotherapy on cancer, comprising the following steps (1) and (2): (1) analyzing the methylation ratio of a cytosine residue in at least one CpG site contained in a nucleotide sequence included in a promoter region, an untranslated region or a translated region of HSD17B4 gene in a sample collected from a human subject; and (2) predicting the effect of the pharmacotherapy on cancer on the basis of the analyzed methylation ratio.La présente invention concerne une mesure qui permet de prédire l'effet d'une pharmacothérapie sur le cancer, y compris le cancer HER2-positif. Plus particulièrement, la présente invention concerne un procédé pour prédire l'effet d'une pharmacothérapie sur le cancer, comprenant les étapes suivantes (1) et (2), consistant à : (1) analyser le taux de méthylation d'un résidu cytosine dans au moins un site CpG contenu dans une séquence nucléotidique incluse dans une région promoteur, une région non traduite ou une région traduite du gène HSD17B4 dans un échantillon prélevé chez un sujet humain ; et (2) prédire l'effet de la pharmacothérapie sur le cancer sur base du taux de méthylation analysé.本発明は、HER2陽性癌等の癌に対する薬物療法の効果を予測可能な指標を提供する。より具体的には、本発明は、以下(1)及び(2)を含む、癌に対する薬物療法の効果の予測方法を提供する: (1)ヒト被験体から採取されたサンプルにおいて、HSD17B4遺伝子のプロモーター領域、非翻訳領域又は翻訳領域にある塩基配列内に存在する1以上のCpGサイト中のシトシン残基のメチル化率を解析すること;並びに (2)解析されたメチル化率に基づいて、癌に対する薬物療法の効果を予測すること。