Η παρούσα εφεύρεση αναφέρεται στην εφαρμογή υψηλής απόδοσης πρωτεϊνικής/πρωτεωμικής και πεπτιδωμικής ανάλυσης της Ελληνικής φέτας για την αναγνώριση των πρωτεϊνών και των πεπτιδίων της. Με τεχνολογίες αιχμής πρωτεωμικής και φασματομετρία μάζας, τύπου 1D-nLC-Orbitrap αναλύθηκαν δείγματα φέτας ώστε ανιχευνεύτηκε, ταυτοποιήθηκε και καταγράφηκε, το πρωτεϊνικό/πρωτεωμικό και πεπτιδικό/πεπτιδωμικό περιεχόμενο τους. Οι πρωτεΐνες και τα πεπτίδια της Ελληνικής φέτας που ορίζονται και περιγράφονται στην παρούσα εφεύρεση μπορούν όλες ή ομάδες εξ αυτών ή συνδυασμοί τους, να αποτελέσουν δείκτες/στόχους και να χαρακτηρίσουν αξιόπιστα και αναμφίβολα ένα λευκό τυρί ως φέτα. Επίσης, χρησιμεύουν στην εκτίμηση της ποιότητας της φέτας, την ιχνηλασιμότητά της, την ταυτοποίηση του είδους του γάλακτος από το οποίο έχει προέλθει, και μπορούν να εντοπίσουν τη νοθεία της.The present invention relates to the application of high-performance proteinic/proteomic and peptidomic analysis of Greek feta cheese for the recognition of its proteins and peptides. By using proteomics and mass spectrometry, of the 1D-nLC-Orbitrap type, feta cheese samples were analysed to detect, identify and monitor their proteinic/proteomic and peptidic/peptidomic content. The proteins and peptides of Greek feta cheese defined and described in the present invention can altogether, or in groups or in combinations, to function as markers/targets and to characterize a white cheese as feta cheese reliably and unambiguously. Also, they serve to evaluate feta cheese quality, traceability thereof, the identification of the kind of milk from which it has been derived, and to detect its fraud.