PROBLEM TO BE SOLVED: To provide methods and compositions that allow targeted modification where artificial nucleases can cleave endogenous genomic sequences with binding site separations other than 5 bp or 6 bp.SOLUTION: Disclosed herein are compositions for linking DNA-binding domains and cleavage domains to form nucleases, such as nucleases with altered target site separation (gap) preferences compared to conventional linkers. Also described are fusion proteins comprising these linkers. The disclosure also provides methods of using these fusion proteins and compositions thereof for targeted cleavage of cellular chromatin in a region of interest and/or homologous recombination at a predetermined region of interest in cells.SELECTED DRAWING: Figure 5COPYRIGHT: (C)2020,JPO&INPIT【課題】人工ヌクレアーゼが、結合部位が5bpまたは6bp以外の長さだけ離れている内因性ゲノム配列を切断し得る、標的化された改変を可能にする方法および組成物を提供する。【解決手段】DNA結合ドメインと切断ドメインとを連結することにより、ヌクレアーゼ、例えば、従来のリンカーと比べて標的部位の間隙(ギャップ)の優先度が変更されたヌクレアーゼを形成するための組成物が、本明細書中に開示される。これらのリンカーを含む融合タンパク質も記載される。本開示は、細胞内において、細胞性クロマチンを目的の領域において標的化切断するためおよび/または目的の所定領域における相同組換えのためにこれらの融合タンパク質およびその組成物を使用する方法も提供する。【選択図】図5