An object of the present invention is to provide a medical diagnosis support device, an endoscope system, and a medical diagnosis support method in which the recognition result of a medical image is highly visible. A medical diagnosis support apparatus according to an aspect of the present invention distinguishes a medical image from an image acquisition unit that acquires medical images in chronological order, a detection unit that detects a region of interest included in the medical image. A discrimination unit to perform, a display control unit for displaying any one of a detection result and a discrimination result on a display device, and a setting unit for setting a waiting time from the detection or discrimination to the display. , The display control unit, when the display target is switched between the detection result and the discrimination result, the detection or discrimination result after the waiting time has elapsed after the detection or discrimination was performed. Display it. [Selection diagram]【課題】本発明は医療画像の認識結果の視認性が高い医療診断支援装置、内視鏡システム、及び医療診断支援方法を提供することを目的とする。【解決手段】本発明の一の態様に係る医療診断支援装置は、医療画像を時系順に取得する画像取得部と、医療画像に含まれる注目領域を検出する検出部と、医療画像の鑑別を行う鑑別部と、検出の結果と鑑別の結果とのうちいずれかを表示装置に表示させる表示制御部と、検出または鑑別が行われてから表示がされるまでの待機時間を設定する設定部と、を備え、表示制御部は、表示の対象が検出の結果と鑑別の結果との間で切り替えられた場合は、検出または鑑別が行われてから待機時間が経過した後に検出または鑑別の結果を表示させる。【選択図】 図7