本发明公开一种细粒棘球蚴EG95蛋白的修饰方法,以及用这种经过修饰后细粒棘球蚴EG95蛋白制备重组表达质粒、重组酵母工程菌,以及重组酵母工程菌诱导表达方法。本发明的对细粒棘球蚴主要免疫原性蛋白EG95的修饰方法是在完整EG95蛋白的基础上,从N-端去除23个氨基酸,从C-端截去22个氨基酸,改造后的tEG95基因序列为SEQ ID No.1,蛋白序列为SEQ ID No.2。用本性发明的方法构建并筛选出酵母单克隆菌株EG95-1于2012年02月16日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,保藏号为CGMCC No.5764。