The present invention provides a method for preparing a modified nucleic acid molecule comprising a nucleic acid portion and a non-nucleic acid portion by reacting a first reactant with a second reactant, wherein the first reactant comprises In connection with the above method, wherein the second reactant is an amino-modified nucleic acid molecule comprising a non-nucleic acid portion and a carboxyl group, and wherein the second reactant is an amino-modified nucleic acid molecule comprising the nucleic acid portion and an amino-modified portion comprising an amino group linked to the nucleic acid portion. Comprises: a) activating a first reactant, preferably a carboxyl group of the first reactant, with a condensing reagent in a water-miscible organic solvent； and b) the activated first reaction of step a). Amino modification of an amino-modified nucleic acid molecule dissolved in a substance, preferably an activated carboxyl group of a first reactant, and a second reactant, preferably in water, or a mixture of a water-miscible organic solvent and water. Department And a step of reacting an amino group, which nucleic acid molecules modified by is formed.本発明は、第１の反応物質と第２の反応物質を反応させることにより、核酸部分及び非核酸部分を含む改変された核酸分子を調製する方法であって、第１の反応物質が、前記非核酸部分とカルボキシル基を含み、第２の反応物質が、前記核酸部分と前記核酸部分に連結したアミノ基を含むアミノ修飾部とを含むアミノ修飾核酸分子である前記方法と関連し、前記方法は、ａ）水混和性有機溶媒中の縮合試薬により第１の反応物質、好ましくは第１の反応物質のカルボキシル基を活性化させるステップと、ｂ）ステップａ）の活性化した第１の反応物質、好ましくは活性化した第１の反応物質のカルボキシル基と、第２の反応物質、好ましくは水中に、又は水混和性有機溶媒と水からなる混合物中に溶解したアミノ修飾核酸分子のアミノ修飾部のアミノ基とを反応させるステップとを含み、これにより改変された核酸分子が形成される。
