本发明属于基因工程领域,涉及一种植物谷蛋白转运储藏相关蛋白OsVHA‑E1及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a)或(b)的蛋白质:(a)由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将SEQ ID NO.1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物谷蛋白转运储藏相关的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质。本发明的植物谷蛋白转运储藏相关蛋白影响植物胚乳中谷蛋白前体的转运储藏。将所述蛋白的编码基因导入谷蛋白转运储藏异常的植物中,可以培育谷蛋白转运储藏正常的转基因植物。所述蛋白及其编码基因可以应用于植物遗传改良。