本发明公开了鸭γ干扰素突变体及其制备方法和应用。本发明确定了SEQ ID NO.1所示序列为鸭γ干扰素的原始氨基酸序列并将其进行信号肽位点突变得到SEQ ID NO.3所示的突变体。本发明进一步将该突变体的基因序列进行密码子优化得到在家蚕中表达效率显著提高的SEQ ID No.6所示的优化基因。本发明在该突变体序列的基础上进行氨基酸单位点突变以及多位点突变获得多个抗病毒活性提高的鸭γ干扰素突变体。本发明进一步利用家蚕杆状病毒表达系统在家蚕生物反应器中表达所述鸭γ干扰素突变体,其抗病毒活性大幅提升,能够用于预防或治疗鸭病毒性疾病,对鸭养殖业中具有重大威胁的病毒性传染病具有显著的防御和抑制作用。