本发明公开一个参与丹参酮类化合物合成代谢的细胞色素P450基因及其编码产物与应用,属于药用植物基因工程领域。该基因为首次从丹参中克隆得到,为丹参酮类化合物合成代谢途径的关键酶基因,催化铁锈醇至11-羟基铁锈醇。本发明所提供的CYP76AH3基因具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。所述基因编码的蛋白质具有序列表中SEQ ID No.2的氨基酸残基序列以及具有SEQ ID No.2的氨基酸残基序列相同活性的由SEQ ID No.2衍生的蛋白质。本发明提供的CYP76AH3基因与丹参酮类化合物合成代谢密切相关,对于调节生产植物二萜类化合物和通过生物技术提高丹参中二萜类活性成分丹参酮类的含量具有重要的理论和实际意义。