本发明提供一种影响猪生长性状的主效SNP标记,所述SNP标记位于猪7号染色体上的HMGA1基因的核苷酸序列上,所述SNP标记的位点为SEQ ID NO:1序列标注位置为857的C857-G857的核苷酸突变,对应于国际猪基因组10.2版本参考序列7号染色体上第34983991个核苷酸位点C>G突变;或为与该位点完全连锁的其它七个位点之一。本发明还提供如上所述的SNP标记在种猪生长性状遗传改良中的应用,以及提供一种与上述SNP标记的连锁不平衡程度(r2)大于0.8的SNP分子标记在种猪生长性状遗传改良中的应用。所述生长性状例如包括猪活体体长、活体体高、胴体长、胴体重、日增重和头重中的一种或多种。本发明能够加快猪种的育种进程,有效提高种猪的生产性能,获得显著的经济效益。