The present invention relates to the field of medicine and in particular to celiac disease (CD). Specifically the present invention relates to methods and means for detection of CD using novel microbiomarker, celiac gut index (CGI). The invention relates also to methods and means for treatment or prophylaxis of CD. The present invention provides a novel product comprising a gut microbiome altering agent that, when administered to an individual, improves the state of health of individuals suffering or susceptible to suffer from celiac disease and possibly reduces the likelihood of acquiring celiac disease. The product of the invention provides a natural and safe manner for the treatment of celiac disease. The present invention provides also a novel method for aiding diagnosis of CD by the specific gut health biomarker, Celiac Gut Index (GCI). In the method a probability of a subject having celiac disease is determined by measuring the relative abundances of one or more microbial taxa in a fecal sample from a subject; and the probability of the subject having CD is determined based on the measured abundances as celiac gut index (CGI).La présente invention concerne le domaine de la médecine et, en particulier, une maladie cœliaque (CD). De façon spécifique, la présente invention concerne des procédés et des moyens pour la détection de CD à l'aide d'un nouveau micro-biomarqueur, un indice d'intestin cœliaque (CGI). L'invention concerne également des procédés et des moyens pour le traitement ou la prophylaxie de CD. La présente invention concerne un nouveau produit comprenant un agent modificateur de microbiome intestinal qui, lorsqu'il est administré à un individu, améliore l'état de santé d'individus souffrant ou susceptibles de souffrir de maladie cœliaque et, le cas échéant, réduit la probabilité de contracter une maladie cœliaque. Le produit de la présente invention concerne une manière naturelle et sûre pour le traitement de maladie cœliaque. La présente invention