A method for characterizing compatibility of a drug for a user includes collecting a set of samples from a set of individuals comprising a set of first individuals who respond to a therapy for a microbiome-related condition and a set of second individuals who do not respond to the therapy for the microbiome-related condition and determining one or more datasets based on the set of samples. A set of microbiome features is extracted from the one or more microbiome datasets, the microbiome features facilitating differentiation between individuals who respond and individuals who do not respond to the therapy. A companion diagnostics model is determined based on the set of microbiome features. The compatibility of the drug for the user is then determined using the companion diagnostics model.L'invention concerne un procédé permettant de caractériser la compatibilité d'un médicament avec un utilisateur qui consiste à recueillir un ensemble d'échantillons à partir d'un ensemble d'individus comprenant un ensemble de premiers individus qui répondent à une thérapie destinée à une affection liée au microbiome et un ensemble de seconds individus qui ne répondent pas à la thérapie destinée à une affection liée au microbiome et à déterminer un ou plusieurs ensembles de données sur la base de l'ensemble d'échantillons. Un ensemble de caractéristiques du microbiome est extrait du ou des ensembles de données du microbiome, les caractéristiques du microbiome facilitant la distinction entre les individus qui répondent et les individus qui ne répondent pas à la thérapie. Un modèle de diagnostic compagnon est déterminé sur la base de l'ensemble de caractéristiques du microbiome. La compatibilité du médicament avec l'utilisateur est ensuite déterminée à l'aide du modèle de diagnostic compagnon.
