Relates to a method of gene expression profiling to inflammatory bowel disease pathogenesis, the IBD markers in one or more in the test sample from a mammalian subject, differential expression relative to the control is determined, the present invention, the test sample is differentially expressed in the test sample I shows the IBD definitive mammalian subjects obtained.本発明は、炎症性腸疾患発病学に対する遺伝子発現プロファイリングの方法に関し、哺乳類被験体からの試験試料における一又は複数のIBDマーカーの、コントロールに対する異なる発現が決定され、試験試料における異なる発現は試験試料が得られた哺乳類被験体おけるIBDを示す。