本发明公开了与脂肪酸合成相关的蛋白GmMYB118及其编码基因与应用。本发明所提供的与脂肪酸合成相关的蛋白,名称为GmMYB118,来源于大豆(Glycine max L.),是如下1)或2)的蛋白质:1)由序列表中序列1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;2)将序列表中序列1的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物脂肪酸合成相关的由1)衍生的蛋白质。将本发明保护的基因GmMYB118在拟南芥中过量表达后,可以提高拟南芥幼苗中脂肪酸的含量。这对提高大豆的脂肪酸含量及相关性状的改良具有重要的理论及实际意义,在农业领域具有广阔的应用和市场前景。