The invention relates to a system in the field of MR guided thermal treatment and more specifically to the temperature control. In the invention an MR and a thermal treatment system are combined. The thermal treatment system is configured to apply thermal treatment pulses to a subject. The prevent overheating of healthy tissue, the thermal treatment pulses are spaced by a cool-down period. The end of the cool-down period is determined by temperature measurements performed during the cool-down period.L'invention concerne un système dans le domaine du traitement thermique guidé par RM et plus particulièrement le contrôle de la température. Dans l'invention, un système de traitement thermique et un système de RM sont associés. Le système de traitement thermique est conçu pour appliquer des impulsions de traitement thermique à un sujet. Pour éviter de surchauffer le tissu sain, les impulsions de traitement thermique sont espacées d'une période de refroidissement. La fin de la période de refroidissement est déterminée par des mesures de températures effectuées pendant la période de refroidissement.