The present invention is a recombinant peptide in which MLS (Mitochondria Localization Sequence) peptide and STAT3 (Signal Transducer and Activator of Transcription 3) are fused; A recombinant vector comprising a polynucleotide encoding the recombinant peptide; And a composition for the prevention or treatment of autoimmune diseases or inflammatory diseases comprising the recombinant peptide or the recombinant vector as an active ingredient, wherein the recombinant peptide or the recombinant vector has STAT3 overexpressed in the mitochondria and IL-throughs the mitochondrial function upward By suppressing the expression of inflammatory cytokines, including 17, it can be useful for the prevention or treatment of autoimmune diseases or inflammatory diseases.본 발명은 MLS(Mitochondria Localization Sequence) 펩타이드와 STAT3(Signal Transducer and Activator of Transcription 3)이 융합된 재조합 펩타이드; 상기 재조합 펩타이드를 암호화하는 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 재조합 벡터; 및 상기 재조합 펩타이드 또는 상기 재조합 벡터를 유효성분으로 포함하는 자가면역질환 또는 염증성질환의 예방 또는 치료용 조성물으로서, 상기 재조합 펩타이드 또는 상기 재조합 벡터는 STAT3가 미토콘드리아 내에서 과발현되어 미토콘드리아 기능 상향을 통한 IL-17를 포함한 염증성 사이토카인의 발현을 억제함으로써 자가면역질환 또는 염증성질환의 예방 또는 치료에 유용하게 사용할 수 있다.