The present invention relates to a stem cell therapeutic agent comprising a vector expressing a bispecific protein comprising anti-IL-6R and TNFR2. More particularly, the present invention relates to a stem cell comprising a mini-circle vector expressing a bispecific protein comprising anti-IL-6R and TNFR2, and a pharmaceutical composition for treating an autoimmune disease comprising the same.본 발명은 항-IL-6R 및 TNFR2을 포함하는 이중특이적 단백질을 발현하는 벡터를 포함하는 줄기세포 치료제에 관한 것이다. 보다 구체적으로, 항-IL-6R 및 TNFR2을 포함하는 이중특이적 단백질을 발현하는 미니서클 벡터를 포함하는 줄기세포, 및 이를 포함하는 자가 면역 질환 치료용 약학 조성물에 관한 것이다.