本发明涉及分子生物学,具体公开了正调控橡胶树花青素合成的R2R3‑MYB转录因子HbAn1及其编码基因与应用。所述转录因子HbAn1的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,其编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明首次从橡胶树中分离出调控花青素合成R2R3‑MYB转录因子HbAn1的编码基因序列,并明确其功能及应用范围。经研究分析发现,HbAn1随着叶片老化及花青素逐渐褪去,其表达量逐渐下降,同时,暗培养嫩茎中HbAn1表达要高于光照培养嫩茎,这与花青素含量正相关。所述转录因子可正调控橡胶树花青素的合成,能够通过自身过表达实现花青素累积量增加。