本发明公开了一种基因4型猪戊型肝炎病毒结构区衣壳蛋白基因及其在制备猪戊型肝炎病毒样颗粒中的用途。本发明的经改造后的基因4型猪戊型肝炎病毒结构区衣壳蛋白基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,本发明同时公开了该基因表达的重组蛋白及制备病毒样颗粒的方法,具体涉及基因4型猪戊型肝炎病毒结构区衣壳蛋白基因的改造、基因的克隆及其在毕赤酵母中的分泌表达,以及重组蛋白形成病毒样颗粒的制备和扩大培养条件等操作方法的改进等步骤。本发明简单易行,成本较低,实现了基因4型猪戊型肝炎病毒结构区衣壳蛋白在毕赤酵母中稳定分泌表达,表达的重组衣壳蛋白可自包装形成病毒样颗粒,为猪戊型肝炎病毒的抗体检测及亚单位疫苗的研制提供了基础。