Disclosed herein are systems and methods for determining alleles, neoantigens, and vaccine compositions determined based on tumor mutations in an individual. Also disclosed are systems and methods for obtaining high quality sequencing data from tumors. Also described herein are systems and methods for identifying somatic changes in polymorphic genomic data. Finally, specific cancer vaccines are described herein.본 명세서에는 개체의 종양 돌연변이를 기초로 결정된, 대립유전자, 신생항원 및 백신 조성물을 결정하는 시스템 및 방법이 개시된다. 또한, 종양으로부터 고품질 서열분석 데이터를 얻기 위한 시스템 및 방법이 개시된다. 또한, 본 명세서에는 다형성 게놈 데이터에서 체세포 변화를 확인하기 위한 시스템 및 방법이 기재되어 있다. 마지막으로, 특유의 암 백신이 본 명세서에 기재되어 있다.
