The present invention provides four purified preparation containing a polynucleic acid molecule encoding porcine Torque teno virus (PTTV) genotypes or subtypes PTTV1 a-VA, PTTV1 b-VA, PTTV2b-VA, and PTTV2c-VA. The present invention also provides infectious DNA clones, biologically functional plasmid or viral vector containing the infectious nucleic acid genome molecule of the same. The present invention further provides live, attenuated, vector-expressed and purified recombinant capsid subunit or killed viral vaccines for protection against PTTV infection. The present invention additionally provides subunit vaccines comprising PTTV specific gene products, especially ORF1 capsid gene product for protection against PTTV infection. Further, the present invention provides methods for diagnosing PTTV infection via polymerase chain reaction (PCR) using specific primer for PTTV1, PTTV2, and individual PTTV1 genotypes. Finally, the present invention provides methods for diagnosing PTTV infection via immunological methods, e.g., enzyme-linked immunoabsorbent assay (ELISA) and Western blot using PTTV specific antigens for detecting serum PTTV specific antibodies.La présente invention concerne une préparation purifiée contenant une molécule d'acide polynucléique codant des génotypes du virus Torque teno porcin (PTTV) des sous-types PTTV1a-VA, PTTV1b-VA, PTTV2b-VA et PTTV2c-VA. La présente invention propose également des clones d'ADN infectieux, un plasmide ou un vecteur viral biologiquement fonctionnel, contenant la molécule acide nucléique génomique infectieuse de ce dernier. La présente invention concerne en outre des vaccins à sous-unité capside vivants, atténués, exprimés par un vecteur et recombinés purifiés ou des vaccins viraux morts pour une protection contre une infection par le PTTV. La présente invention concerne de plus des vaccins à sous-unité comprenant des produits géniques spécifiques du PTTV, en particulier le produit du gène de capside ORF1 pour une protectio