本发明涉及一种盐藻光合代谢途径关键酶NADP-甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因、编码蛋白及其克隆和蛋白表达方法。本发明的一种盐藻光合代谢途径关键酶NADP-甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因具有有SEQ NO 5所示的碱基序列,其编码蛋白具有SEQ NO 6所示的氨基酸序列。本发明将来源于衣藻的甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因的同源片段作为探针首次克隆到一个盐藻特异的甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因,并对其序列和编码的蛋白序列进行初步的分析,同时对该基因进行了初步功能分析,在此基础上探讨盐藻这个单细胞绿藻在植物从低等到高等植物进化过程中的地位;本发明在高盐胁迫情况下对其转录水平表达进行研究,以从分子水平上进一步明确这个基因及其编码的酶蛋白在参与光合作用卡尔文循环过程中的生物学功能的保守性,同时揭示这个基因在盐藻响应环境胁迫过程特别是在渗透胁迫过程中的生物学功能的特异性。