本发明公开了一种茉莉酸甲酯应答的人参PgPDR3基因启动子及其应用。该人参PgPDR3基因启动子序列如SEQ ID NO.1所示，或是与SEQ ID NO.1具有99%以上同源性的DNA序列。本发明采用Genomewalker技术克隆得到PDR转运蛋白基因启动子序列，并构建启动子表达载体pCAMBIA1301-ProPDR3::GUS，在转基因烟草中该启动子驱动GUS表达，并且较强地受人参皂苷、水杨酸、赤霉素和脱落酸的调控，表明该启动子参与调控人参皂苷的转运和积累，这为克隆人参皂苷转运信号途径中关键的调控转录因子基因、以及调控人参皂苷等萜类化合物的转运与积累等奠定了基础。通过该启动子或其衍生物调控或改良人参及其它植物，可获得人参皂苷含量高的优良植物品种。
