The present invention relates to a data analysis method and system for assisting disease diagnosis, and more particularly, to a technology and system capable of providing analysis results through integrated analysis of clinical, MRI image, and genomic data to assist disease diagnosis. Receiving medical data of the subject as related; Selecting disease-related data using the medical data; And calculating the disease probability according to the selected disease-related data, wherein the medical data discloses a configuration including clinical records, genes and genetic mutations, and MRI.본 발명은 질환 진단 보조를 위한 데이터 분석 방법 및 시스템에 관한 것으로, 더욱 상세하게는 질환 진단을 보조하기 위하여 임상, MRI 이미지, 유전체 데이터의 통합적 분석을 통한 분석 결과를 제공할 수 있는 기술 및 시스템에 관한 것으로 대상자의 의료 데이터를 입력받는 단계; 상기 의료 데이터를 이용해 질환 관련 데이터를 선별하는 단계; 및 선별된 상기 질환 관련 데이터에 따른 상기 질환 확률을 계산하는 단계;를 포함하고, 상기 의료 데이터는 임상 기록, 유전자 및 유전자 변이 및 MRI를 포함하는 구성을 개시한다.