The present disclosure discloses a scanning imaging system comprising a transport device, a first imaging system and a second imaging system. In the transport direction, the distance between the light beam from the first light beam generator of the first imaging system and the light beam from the second light beam generator of the second imaging system is approximately L. The controller calculates, based on the count value of the encoding counter module, data at the position of the subject in the carrying direction collected by the first imaging system and data at the position of the subject in the carrying direction collected by the second imaging system Wherein the count value of the encoder corresponding to the data at the position collected by the first imaging system and the count value of the encoder corresponding to the data at the position collected by the second imaging system Is approximately L / D. The present disclosure can achieve alignment of a DR data image and a CT data image in a simple manner.본 개시 내용은 운반 장치, 제1 촬상 시스템 및 제2 촬상 시스템을 포함하는 스캐닝 촬상 시스템을 개시한다. 운반 방향에 있어서, 제1 촬상 시스템의 제1 광선 발생기로부터의 광선 빔과 제2 촬상 시스템의 제2 광선 발생기로부터의 광선 빔 사이의 거리는 대략 L이다. 제어기는 인코딩 카운터 모듈의 카운트 값에 기초하여, 제1 촬상 시스템에 의해 수집되는 운반 방향에서의 피검체의 위치에서의 데이터와 제2 촬상 시스템에 의해 수집되는 운반 방향에서의 피검체의 위치에서의 데이터 사이의 대응 관계를 획득하도록 구성되며, 제1 촬상 시스템에 의해 수집되는 위치에서의 데이터에 대응하는 인코더의 카운트 값과 제2 촬상 시스템에 의해 수집되는 위치에서의 데이터에 대응하는 인코더의 카운트 값 사이의 차이는 대략 L/D이다. 본 개시 내용은 간단한 방식으로 DR 데이터 이미지와 CT 데이터 이미지의 정렬을 달성할 수 있다.