本发明提供了一种用于转基因水稻KF6、TT51、KMD1的定性和定量PCR检测的重组标准质粒,由如下方法获得:将SEQ ID No.1所示的KF6侧翼序列、SEQ ID No.2所示的TT51侧翼序列、SEQ IDNo.3所示的KMD1侧翼序列和SEQ ID No.4所示的PLD基因依次连接获得融合片段,再将所得融合片段克隆到载体pMD18-T中,获得所述重组标准质粒,记为pMD-KTK。该重组标准质粒可以替代转基因水稻KF6、TT51和KMD1的阳性标准品,用于对转基因水稻KF6、TT51、KMD1转化体特异性定性和定量PCR检测,具有特异性好、灵敏度高等优点,应用该重组标准质粒进行实际样品定量分析时,样品检测结果的偏差在国际上广泛认可的允许范围内,很好地解决了转基因水稻KF6、TT51、KMD1在检测过程中阳性标准品匮乏的问题。