It is an object of the present invention to provide means for directly evaluating the content of mesenchymal stem cells in various forms of cell-containing samples such as adipose tissue. The present invention is a method for evaluating the content of mesenchymal stem cells in a sample containing cells, from other cells in the base sequence of the CD31 promoter or its complementary strand contained in the genomic DNA obtained from the sample The present invention also relates to a method having a nucleic acid detection step of detecting a base sequence containing at least one CpG site that is highly methylated in mesenchymal stem cells.本発明は、脂肪組織等の各種形態の細胞含有試料において間葉系幹細胞の含有量を直接的に評価するための手段を提供することを課題とする。 本発明は、細胞を含む試料における間葉系幹細胞の含有量を評価する方法であって、前記試料から取得したゲノムＤＮＡに含まれるＣＤ３１プロモーター又はその相補鎖の塩基配列中の、他の細胞よりも間葉系幹細胞においてメチル化されている割合が高いＣｐＧ部位を少なくとも１つ含む塩基配列を検出する核酸検出工程を有する方法に関する。
