Disclosed is a vehicle air conditioner having an ion generator capable of installing an ion output unit in a plurality of sites by a single ion generator and preventing electromagnetic generation due to high voltage transmission. An air conditioner for a vehicle having an ion generator includes an air inlet case formed at an inlet side, a plurality of air outlet ports formed at an outlet side, and an air passage formed to communicate the air inlet port with an air outlet port therein； An evaporator installed on an inner air passage of the blower unit, a blower unit installed on the air inlet side and blowing air into the air conditioning case, and an ion generator generating ions by applying power. A first main body including a supply unit, a first high voltage amplifier for amplifying the input power of the power supply unit with a high voltage, and a first output unit for generating ions through the high voltage amplified by the first high voltage amplifier, and the first body A second high voltage amplifying unit which receives power from the second high voltage amplifying unit and amplifies to a high voltage； It is composed of a second output unit for generating ions through a wide high voltage, and has a second body spaced apart from the first body. Therefore, the ion output unit can be installed at a plurality of sites by a single ion generator, and electromagnetic generation due to high voltage transmission can be prevented.단일개의 이온 발생기로 이온 출력부를 다수개의 부위에 설치 가능함과 아울러 고전압 전달에 따른 전자파 발생을 방지할 수 있는 이온 발생기를 구비한 차량용 공조장치가 개시된다. 이온 발생기를 구비한 차량용 공조장치는 입구측에 공기유입구가 형성되고 출구측에 다수의 공기토출구가 형성되며 내부에 상기 공기유입구와 공기토출구를 연통시키도록 공기 통로가 형성된 공조케이스와, 상기 공조케이스의 내부 공기 통로 상에 설치되는 증발기와, 상기 공기유입구 측에 설치되어 공조케이스의 내부로 공기를 송풍하는 블로어 유닛과, 전원 인가에 의해 이온을 발생시키는 이온발생기를 포함하며, 상기 이온발생기는 전원 공급부와 상기 전원 공급부의 입력 전원을 고전압으로 증폭하는 제1 고전압 증폭부와 상기 제1 고전압 증폭부에 의해 증폭된 고전압을 통해 이온을 발생시키는 제1 출력부로 구성된 제1 본체와, 상기 제1 본체로부터 전원을 공급받아 고전압으로 증폭하는 제2 고전압 증폭부와, 상기 제2 고전압 증폭부에 의해 증폭된 고전압을 통해 이온을 발생시키는 제2 출력부로 구성되며, 상기 제1 본체와
