本发明涉及生物医学技术领域,是一种抗肠道病毒71型感染的新靶点及应用。本发明以人脑微血管内皮细胞(HBMEC)作为靶细胞,采用RNA干扰技术下调靶细胞宿主蛋白的表达,来寻找可有效抑制EV71感染人脑微血管内皮细胞(HBMEC)的宿主因子,从而保护血脑屏障的功能,预防病毒穿过血脑屏障感染中枢神经系统。本发明通过实验发现蛋白酪氨酸激酶FYN癌基因(FYN proto‑oncogene,Src family tyrosine kinase)分子在EV71感染HBMEC中发挥着重要的作用,下调FYN的表达,能明显抑制EV71的感染。本发明提供了FYN在制备预防或治疗肠道病毒71型感染药物中的应用。