本发明涉及一种水稻花粉萌发孔发育及花粉育性基因OsAOM、突变基因及其重组表达载体和应用,该基因编码的蛋白为SEQ ID NO.1所示氨基酸序列,或经过取代、缺失或添加至少一个氨基酸且具有与OsAOM功能相同的蛋白质;SEQ ID NO.1所示氨基酸序列组成的蛋白质,其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,还公开了OsAOM基因的重组表达载体,本发明公开的OsAOM基因编码一个GDSL脂肪酶,具有调控花粉萌发孔生长,小孢子细胞膜扩张及花粉内壁和细胞质发育的功能,是小孢子发育成可育花粉的必须基因,该基因功能的缺失会导致萌发孔结构紊乱,小孢子细胞膜及细胞质降解,花粉内壁不能形成,产生水稻雄性不育。