The present invention provides a nucleic acid having an expression inhibiting activity of MASP2, a pharmaceutical composition comprising the nucleic acid, and a prophylactic or therapeutic drug for autoimmune diseases such as APS and SLE and thrombosis in hemodialysis.본 발명은 MASP2의 발현 억제 활성을 갖는 핵산, 그 핵산을 포함하는 의약 조성물 및 그 핵산을 포함하는, APS, SLE 등의 자가 면역 질환과 혈액 투석에 있어서의 혈전증의 예방약 또는 치료약을 제공한다.