本发明提供了白菜干细胞决定基因BrWUS1及其应用,属于植物基因工程技术领域。所述白菜干细胞决定基因BrWUS1的DNA序列如SEQ ID No.1所示。通过农杆菌浸花转化法将该基因转化至哥伦比亚型拟南芥中,得到BrWUS1异源表达拟南芥株系,结果发现,白菜干细胞决定基因BrWUS1的异源表达会导致拟南芥叶片数目变多,叶片变小,分枝数明显增多,初生根的根长显著变短,花粉活力下降,出现异位花器官。这表明白菜干细胞决定相关基因BrWUS1在分生组织活性、叶片、初生根、花器官及其雄蕊发育方面发挥重要的调控作用,可将该基因应用于白菜类蔬菜及其他园艺植物育种,具有良好的应用前景。