本发明提供一种抗新型冠状病毒S蛋白的CAR‑T细胞,所述CAR‑T细胞,经抗新型冠状病毒S蛋白优化的单链抗体基因修饰,所述优化的单链抗体为序列表中SEQ ID NO.2所示的核苷酸;所述新型冠状病毒为COVID‑19;本发明还提供上述CAR‑T细胞的制备方法和应用。本发明提供一种免疫细胞疗法CAR‑T技术,可以精准清除体内感染的COVID‑19病毒细胞,安全高效的治疗新型冠状病毒,本发明构造的CAR‑T细胞杀伤效果显著,对表达COVID‑19病毒S蛋白抗原的细胞杀伤率高达90%以上;本发明首次利用单个B淋巴细胞克隆和筛选策略技术筛选出针对COVID‑19病毒的scFv(单链抗体)。