本发明公开了一种绿豆抗豆象基因VrPGIP等位基因VrPGIP1‑ACC41、分子标记及应用。基因序列为:编码SEQ ID NO.2所示氨基酸序列的蛋白质的核苷酸序列;或上述核苷酸序列经取代、缺失和/或增加核苷酸且表达相同功能蛋白质的核苷酸;或在严格条件下与上述核苷酸序列杂交且表达相同功能蛋白质的核苷酸;或与上述核苷酸序列具有90%以上同源性且表达相同功能蛋白质的核苷酸。所述分子标记包含所述基因第373bp、第385bp、第562bp和第1006bp处的多态性位点。本发明获得了新的绿豆抗豆象基因及其分子标记,提供了新的基因资源,对绿豆抗豆象育种工作具有重要意义。