本发明公开了转基因水稻科丰2号品系特异性实时荧光定量PCR检测引物、检测方法和试剂盒。所述PCR检测引物的核苷酸序列为SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示,所述探针的核苷酸序列为SEQ ID No.4所示。本发明还公开了一种转基因水稻科丰2号品系特异性的实时荧光定量PCR检测方法,包括:(1)提取待检测水稻样品的DNA;(2)以提取的DNA为模板,以所述特异性检测引物建立PCR反应体系并进行扩增;(3)根据收集的荧光曲线和Ct值判定检测结果。特异性、灵敏度、可靠性和检测限实验结果表明,本发明转基因水稻科丰2号品系特异性实时荧光定量PCR检测方法特异性强、灵敏度高、可靠性好。