PROBLEM TO BE SOLVED: To provide methods for selection of proteases or mutant proteases with desired substrate specificities and activities.SOLUTION: Methods for identifying modified proteases with modified functions comprises screening candidate and modified proteases by contacting them with a substrate, such as a serpin, an alpha macroglobulin or a p35 family protein or a modified serpin and a modified p35 family member or a modified alpha macroglobulin, that, upon cleavage of the substrate, traps the protease by forming a stable complex.SELECTED DRAWING: Figure 1【課題】 所望の基質特異性および活性をもつプロテアーゼまたは突然変異体プロテアーゼの選択方法を提供すること。【解決手段】 候補および修飾プロテアーゼを、基質の開裂時に、安定した複合体を形成することによりプロテアーゼを捕捉する基質、例えばセルピン、アルファマクログロブリンまたはp35ファミリータンパク質または修飾セルピンおよび修飾p35ファミリーメンバーまたは修飾アルファマクログロブリンと接触させることにより、それらをスクリーニングし、改変された機能を有する修飾プロテアーゼを同定することにより上記課題を解決する。【選択図】図1