The marking system comprises: a marker arranged to penetrate through the wall of the luminal organ an applicator having a penetrating portion penetrable in the wall portion and containing at least a portion of the marker And an indicating device having an insertion portion capable of entering the insertion portion and a light source portion disposed in the insertion portion, at least a part of the insertion portion being provided on the outer peripheral surface And has a light shielding property for suppressing leakage of light emitted from the light source portion to the outside of the insertion portion.マーキングシステムは、管腔臓器の壁部を貫通するように配置されるマーカーと、壁部に刺入可能な刺入部を有し、マーカーの少なくとも一部が収容されるアプリケータと、可撓性を有して長尺に形成され、刺入部が進入可能な挿入部と、挿入部内に配置された光源部とを有する指示デバイスとを備え、挿入部の少なくとも一部は、外周面に光源部から発せられた光が挿入部外に漏れるのを抑制する遮光性を有する。
