Embodiments of a method and/or system for characterizing a headache-related condition for a user can include one or more of: generating a microbiome dataset for each of an aggregate set of biological samples associated with a population of subjects, based on sample processing of the biological samples; processing a supplementary dataset associated with one or more headache-related conditions for the set of users; and performing a characterization process for the one or more headache-related conditions, based on the supplementary dataset and microbiome features extracted from the microbiome dataset.Des modes de réalisation de la présente invention concernent un procédé et/ou un système pour caractériser une affection liée à une céphalée pour un utilisateur, qui peuvent comprendre l'un ou plusieurs parmi : la génération d'un ensemble de données de microbiome pour chacun d'un ensemble agrégé d'échantillons biologiques associés à une population de sujets, sur la base d'un traitement d'échantillon des échantillons biologiques ; le traitement d'un ensemble de données supplémentaire associé à une ou plusieurs affections liées à une céphalée pour l'ensemble d'utilisateurs ; et la conduite d'un processus de caractérisation pour les une ou plusieurs affections liées à une céphalée, sur la base de l'ensemble de données supplémentaire et des caractéristiques du microbiome extraites de l'ensemble de données de microbiome.