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一种用于猪基因编辑的高效特异性sgRNA识别位点引导序列及其筛选方法
- 专利权人:
- 广东省农业科学院农业生物基因研究中心
- 发明人:
- 陈庄,刘文华,蒋宗勇,张群洁,戴彰言,俞婷,陈中健,朱翠
- 申请号:
- CN201610248143.3
- 公开号:
- CN105886616A
- 申请日:
- 2016.04.20
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 龚燮英
- 摘要:
- 本发明公开了一种用于猪基因编辑的高效特异性sgRNA识别位点引导序列及其筛选方法,所述筛选方法包括步骤:功能基因筛选及ORF分析、功能基因sgRNA识别位点引导序列预测、全基因组脱靶位点检测、依据脱靶信息与靶位点位置对预测的靶位点打分,排序、结果筛选与统计、算法优化与软件开发。本发明的猪的特异性sgRNA识别位点引导序列经过了严格的筛选与检验,包含所有猪蛋白编码基因的用于CRISPR‑Cas9基因编辑的sgRNA识别位点引导序列;本发明中对特异性sgRNA识别的鉴定、打分和检验算法,以及算法对应的用于预测和评估猪的功能基因sgRNA识别位点引导序列的软件可广泛用于具有全基因组序列的非模式物种的sgRNA特异位点预测。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/