The present invention relates to a lyophilized composition comprising an intact ecosystem microflora, in particular feces, and a mixture of cryoprotectants comprising maltodextrin and trehalose, a capsule comprising the lyophilized composition, It relates to the use as well as the production method. [Selection figure] None本発明は、生態系のままの微生物叢、特に糞便と、マルトデキストリン及びトレハロースを含む凍結保護物質の混合物とを含む凍結乾燥された組成物、上記凍結乾燥された組成物を含むカプセル剤、その使用、並びにその製造方法に関する。【選択図】なし