本发明公开了一种猪链球菌2型溶血素溶血活性基因突变株及其疫苗制备和应用。该突变株命名为streptococcus suis type 2mSly(P353L)‑SC‑19,其保藏编号为:CCTCC M 2016077。所述突变株中溶血素基因碱基序列上1056bp至1059bp的基因序列为TTA。该突变株结合了基因缺失疫苗和毒力因子免疫保护研究的优点,使菌株既缺失猪链球菌II型溶血素的毒性,又具有溶血素蛋白的免疫源性。该菌株特点仍然表达完整的溶血素蛋白,但是不具有溶血活性,该菌株对细胞的毒性大大降低;菌株的溶血素溶血活性突变后,仍然能激活机体产生溶血素蛋白的抗体,具有很好的保护效应。