Method and system for underwater hyperspectral imaging of fish comprising hyperspectral imaging of a fish freely moving in an observation area and identifying and classifying physiological properties of fish or identifying and classifying on identified fish.L'invention concerne un procédé et un système d'imagerie hyperspectrale sous-marine de poissons (90) comprenant l'imagerie hyperspectrale d'un poisson (90) se déplaçant librement dans une zone d'observation (100) et l'identification et la classification des propriétés physiologiques du poisson ou l'identification et la classification de poissons (90) identifiés.