本发明公开了一种逆转录转座基因L1‑FGGY及其作为肺鳞癌标志物的用途。所述逆转录转座基因L1‑FGGY的核酸序列为SEQ ID NO.1。所述逆转录转座基因L1‑FGGY的上游检测引物核酸序列为SEQ ID NO.2;下游检测引物核酸序列为SEQ ID NO.3。所述逆转录转座抑制剂奈韦拉平或依法韦仑可以抑制逆转录转座基因L1‑FGGY的表达水平,用于治疗肺鳞癌。本发明公开的L1‑FGGY逆转录转座基因可以作为一个新的肿瘤标志物,对L1‑FGGY的检测可以用以进行肺鳞癌的早期诊断、分子分型,以及预后评估,同时L1‑FGGY还可能成为一个潜在的治疗靶点,应用于肺鳞癌的临床治疗,具有广阔的应用前景。