The present invention provides a medical imaging system 100, 300, 400 having a memory 110 for storing machine-executable instructions 120 and a processor 106. Execution of the machine-executable instructions causes the processor to receive a magnetic resonance image 122 (200)； metadata describing the magnetic resonance image having reference grayscale value data 124 for two or more tissue types. Receiving (202)； and segmenting the magnetic resonance image using an image segmentation algorithm 126 using the reference grayscale value data (204).本発明は、マシン実行可能な命令１２０を格納するメモリ１１０及びプロセッサ１０６を有する医療用撮像システム１００，３００，４００を提供するものである。上記マシン実行可能な命令の実行は、上記プロセッサに、磁気共鳴画像１２２を受信させ（２００）；２以上の組織型に関する基準グレイスケール値データ１２４を有する、該磁気共鳴画像を記述するメタデータを受信させ（２０２）；及び該基準グレイスケール値データを使用する画像セグメンテーションアルゴリズム１２６を用いて前記磁気共鳴画像を分割させる（２０４）。
