The present invention relates to a method of lyophilizing a sample of a fecal microbiota of a donor subject, comprising the following steps: A) mixing a sample of fecal microbiota of a donor subject with a diluent selected from polyols, di-pentasaccharides, maltodextrins and mixtures thereof, and B) freezing the mixture obtained in A) at a temperature below -50 ° C, preferably between -70 ° C and -100 ° C, and then lyophilization.Procédé de lyophilisation d'un échantillon de microbiote fécal La présente invention se rapporte à un procédé de lyophilisation d'un échantillon de microbiote fécald'un sujet donneur, comprenant les étapes suivantes: A) le mélange d'un échantillon de microbiote fécal d'un sujet donneuravec un diluant choisi parmiles polyols, les di-à pentasaccharides, les maltodextrines et leurs mélanges, et B) la congélation du mélange obtenu en A) à une température inférieure à -50°C, de préférence comprise entre -70°C et -100°C, puis sa lyophilisation.
